破灭的序幕

距离那场天地齐喑，神愁鬼哭的人神大战已经过去五十年了。
然而，乾坤不休运转，命运之轮永不停息。
五十年前，通天教主倾尽截教全力设置的万仙阵，还是在阐教和西方教联手下轻易瓦解。通天教主精心准备，企图挽回败局的秘宝：六魂幡，对两教四位教主的神圣之身更是没有任何作用。急怒攻心之下，通天教主再图反抗，却因师尊鸿钧道人的驾临而被迫放弃。
是役后，截教大伤元气，一蹶不振。失败的耻辱，对封神计划与玉虚宫“阴谋“的不满，使通天教主渐渐丧失了应有的判断能力。通天教主再也无法忍受隐居修道的生活，派多宝道人前往西方教召回于万仙阵中被收去的乌云仙、虬首仙、金光仙等人，却遭到西方教的的拒绝。通天教主一怒之下，亲往天界火云宫，进见伏羲、神农、轩辕三皇，痛斥截教之冤，阐教之过。适逢太上老君进见，双方又在三皇面前据理力争。三皇好言规劝通天教主，通天教主大怒而去。
五十年前被西方教带走的乌云仙、虬首仙、金光仙三人，在西方的修行并不如意。相形之下，北方的异民族却对三仙敬若上宾。在通天教主的安排下，三仙相继用计回到截教，并带来了异民族的帮助。截教的元气正在恢复，通天教主更惊人的计划正在一步一步实现。

定海珠

在上一次恢弘的封神战争中，燃灯道人偶然得到了元始以后便杳然无踪的玄都至宝――定海珠。定海珠共有二十四颗，也是二十四诸天的化身。定海珠是玄道的根本，拥有莫大的威力。如果定海珠受到破坏，不只是阐教和截教，就是西方教（即后来的佛教）也会发生异变。而通天教主的阴谋，正是施展天地俱焚的映日包金术，毁掉定海珠，不惜用人神俱灭为代价为自己报仇。这个阴谋最困难的地方，莫过于如何从阐教窃取被严密保藏的定海珠。
时机还没有成熟。天龙八部中夜叉的到来改变了整个局面。这个当年战败而被西方抓走的夜叉，等了五十年，总算躲过了准提道人和接引道人的视线，成功逃了回来。它的消失并没有引起准提道人和接引道人的注意。对于忙于扩张西方势力的他们来说，夜叉是没有时间关心的无足轻重的小角色。通天教主趁机将夜叉和众妖派往下界，制造混乱，企图趁机盗取如意珠和定海珠。

逆城革命

分封在殷王朝旧址为王的纣王之子武庚，在太庙祭祀时偶然发现了历代先帝之灵位。这些灵牌原本在西周攻破朝歌时由微子、微子启、微子衍三兄弟带走，但此三人已隐姓埋名，移居他乡，无法找寻。武庆睹物思人，回想起自己的父亲原本乃是真命天子，竟被叛国逆臣所杀，再念及各诸侯的百般刁难，不觉勃然大怒，自思此恨不报，有何面目立于天地。
从此武庆回到东方，纠集起五十路诸侯，先除掉了东伯侯姜文焕、北伯侯崇应澜，后又召集西伐大军，积极联络各地异族，获十位勇将相助，号称讨西十星。历经3年时间，组织反周同盟，准备发动起义。

魔踪重现

天将大乱，必有不祥之兆。妖魔鬼怪又开始在人间悄悄出现。武王为了消除妖魔之乱，随即命令各路诸侯发兵灭妖，武王亦派出近卫军进行扫荡，以示决心。
妖怪们的突然出现，使下界陷入一片混乱。从西方教逃走的夜叉也在人间肆意残杀人类，更加剧了下界的混乱。
阐教的众仙人只得纷纷下山，以镇压妖怪们的侵扰。

叛乱：映日包金术

时机终于成熟了，通天教主率领截教众仙人，突袭空虚的玉虚宫。乌云仙、虬首仙、金光仙趁机成功盗取了如意珠与定海珠，便罢战回到***。
原始天尊和太上老君迅速招来十二上仙迅速赶到***。在***门口，多宝道人、武当圣母、乌云仙、虬首仙、金光仙等与阐教众仙人发生大战，但由于布阵仓促，很快便被十二上仙攻破，乌云仙、虬首仙、金光仙也在这场大战中丧生。得知夜叉肆虐人类的消息，准提道人和截引道人也赶到了***。阐教、截教、西方诸道人再次兵戎相见。
突然一声雷鸣巨响，一道巨大的光芒直入云霄。瞬间，乌云压境，遮天蔽地，雷雨大作。通天教主的映金包日术成功了。映金包日术是销形破魂的法术，是道术、法术、仙术的最高境界。定海珠的破裂开始使仙界道人的法力出现异变。仙界的法术开始慢慢消失，法力的拥有者或者成为魂魄，或者迅速地衰老下去。
通天教主施展映金包日术成功后，与如意珠一同消失，原始天尊、太上老君、准提道人、接引道人和十二上仙立刻自我封印之后，不知掉到下界的何处。

封神台的迸裂

此时被封印在北海的申公豹，趁乱逃出。对阐教心怀怨恨的申公豹高高的举起雷公鞭，运用最大的力量砸向封神台。终于，他还是如愿破坏了封神计划。
封神台一分为二，刚刚建立的神界崩溃了。被封印的魂灵降临人间，成为异常的人或者动物。下界的妖怪们大部分丧魂失魄，而漂浮在空中的其他魂魄却迅速潜入了这些妖怪的肉身当中，成了像僵尸一样的东西，他们虽然魂魄已换，但习性却没有改变，其行为与原来的妖怪无异，还更加残暴。

众仙之塔

神界崩溃后，三教众仙分别于人界东部、终南山脚、黑水之边等三处分别建立起了截、阐、诸佛三塔，并用自己仅剩的最后一点法力将自己封印于塔内。

天下大乱

仙界在定海珠的破裂下崩溃，仙界既崩，乾坤也乱，三界即刻陷入阴阳颠倒之中。
乱世既出，野心家闻风而动，纷纷陈兵以备，妄图夺取天下而王者比比皆是。北方异族窥觎华夏疆土已久，更是乘机侵入，妖魔肆虐及各方诸侯遇袭身亡等事的层出不穷，使得周国上下都处于巨大的不安之中。因此武庆准备起义之言一经传出，各路诸侯均犹疑不定，不知该归顺何方。而此时的周朝倾全国之兵致力于剿灭妖魔，无暇平乱。
随着异族攻势的不断增强，北方形势逐渐恶化，各地阵线不断向南收缩，无数诸侯战死沙场。而事实上异族的侵入与武庆亦有关联，武王九年三月九日，就在异族侵入周国之后不久，武庆于太庙中向天地神灵祈福，举兵起义。各路诸侯虽未效忠武庆，但趁着天下大乱，随后亦纷纷树起反旗，攻向朝歌。

渭水之域：决战

面对天下巨变，武王集结大军，纷纷打退各路诸侯。而武庆以东、北两地为据点所组织起来的讨西大军，也沿黄河而上协同北方异族，攻击周朝军队，在黄河之上，渭水之滨，两军正面遭遇。五十年前的宿命又一次轮回，决战即将再度重演……
就在大战一触即发之时。突然间，天空乌云密布，风雨大作，黑不见光。众多诸侯之魂魄，瞬间消失，武王与武庆的魂魄亦即不知踪影，两军人马各个魂飞魄散，两军阵前只剩肉身。不久，这些肉身又被另一些魂魄所填满。

劫后

仙界里正进行的战争，使下界的妖魔失去了钳制。这些练就出强大魔力的妖精们来到了人间，肆意杀虐人类。整个人间笼罩在邪恶的力量当中，混乱不堪。就这样，一心只想复仇的“通天教主”，犯下大错，将人类推入了无尽的黑暗当中。
幸存下来的仙人们，把带有高贵灵魂的人类收为徒弟，重新建立三界的秩序，拯救失去控制的华夏大地……